Co to jest wiązanie peptydu?

Wiązanie peptydu jest wiązaniem amidowym między cząsteczkami polipeptydu i białka w aminokwasach, znanych również jako łańcuch peptydowy.Wiązanie kowalencyjne jest charakterystyczne dla wiązania peptydu i jest niezbędne do normalnej syntezy peptydu.Innymi słowy, wiązania peptydowe łączą aminokwasy w określonej kolejności, która tworzy polimery białkowe i kieruje tworzeniem unikalnego, trójwymiarowego (struktury 3D. Bez wiązania peptydu, ważne reakcje dotyczące aminokwasów stają się hamowane.

Pod względem chemii molekularnej, łączenie dwóch lub więcej aminokwasów tworzy cząsteczkę peptydową. wiązanie peptydowe tworzy się, w której cząsteczka kwasu karboksylowego reaguje z grupą aminową w następnej cząsteczce aminokwasowej. Powstała cząsteczka to dipeptyd i mdash; dwa aminokwasy połączone ze sobą peptydem peptydemwiązanie. Wiązania peptydowe są unikalne dla grupy aminowej, z którą łączą się. Proces syntezy peptydowej lub syntezy białek obejmuje tworzenie łańcucha peptydowego i szereg reakcji biochemicznych z różnymi typami cząsteczek kwasu rybonukleinowego (RNA) mdash; komunikator, rybosomalny i transferowy RNA mDash; i aminokwasy. Synteza białek ma miejsce, gdy rybosom tłumaczy RNA komunikatora (mRNA), a wiązanie peptydowe tworzymiędzy dwiema cząsteczkami aminokwasów po translacji.Za każdym razem występuje wiązanie peptydowe, do tego, co nazywa się łańcuchem polipeptydowym.W niektórych okolicznościach wiele rybosomów może przetłumaczyć tę samą nici mRNA, co powoduje duplikatywne wiązanie peptydowe, a zatem duplikat łańcuchów peptydowych.

Po zakończeniu syntezy białek, łańcuch polipeptydowy jest uwalniany przez reakcję katalizowaną przez enzymatStruktura 3D, która staje się biologicznie aktywnym białkiem.Skuteczność niektórych antybiotyków stosowanych w leczeniu infekcji bakteryjnych opiera się na wiązaniu peptydu podczas syntezy białek.Zakłócając tworzenie się białek potrzebnych przez bakterie, antybiotyki mogą powstrzymać pomnożenie bakterii. Antybiotyki, które hamują wiązanie peptydów, również hamują syntezę białka.Wiele antybiotyków nie może specyficznie celować w niezdrowe komórki, więc kończą się na zdrowych komórkach podczas tego procesu, chociaż istnieją niektóre leki, które działają tylko na komórki bakteryjne poprzez celowanie w rybosomy bakteryjne.Mechanizm działania antybiotyków może zapobiegać transkrypcji RNA lub wzrostu łańcuchów peptydowych poprzez hamowanie tworzenia wiązania peptydowego.Inne mechanizmy obejmują niepełne kodowanie białek i zapobieganie transkrypcyjnym RNA (TRNA), z których wszystkie opierają się na wiązaniu peptydów za pośrednictwem biochemicznej.

Potrzeba firm syntezy peptydów pojawiła.Usługi peptydowe na żądanie obejmują niestandardowe sekwencjonowanie ze spektrometrią mas lub rozwój katalogu peptydowego lub biblioteki peptydowej.Niektórzy z tych dostawców usług dostarczają również zmodyfikowane peptydy i materiały do syntezy.