Co to jest sekwencja peptydowa?

Peptydy są polimerami biologicznymi utworzonymi przez łączenie aminokwasów, których kluczowymi elementami są węgiel (C), wodór (H), tlen (O) i azot (N).Termin sekwencja peptydowa odnosi się do kolejności połączenia aminokwasów.Peptydy są bardzo ważne w systemach żywych i łączą się, tworząc znacznie większe łańcuchy zwane białkami.Chociaż istnieje wiele odmian peptydów biologicznych, większość z nich składa się z zaledwie 20 aminokwasów.Białka wykonują szereg funkcji biologicznych, w tym jako enzymy i w strukturze ścian komórkowych w roślinach i błonach w komórkach zwierzęcych.

Aminokwasy są tak nazywane, ponieważ mają aminę (-NH ₂ ) i kwas karboksylowy (-CO (-CO. ₂ h) Grupy.Większość aminokwasów znalezionych w układach biologicznych ma ogólną formułę R-CH (NH ₂ ) -CO ₂ H, gdzie R jest zakresem grup.Różna struktura R wpływa na strukturę i właściwości peptydów i białek. Synteza peptydów występuje, gdy jeden aminokwas grupa aminowa reaguje z grupą kwasu karboksylowego na innym aminokwasie.Rezultatem jest tworzenie grupy amidowej struktury -N (H) -CO-, w której wiązanie azot-węglowe nazywa się wiązaniem peptydowym.Reakcja może odbywać się wiele razy w celu tworzenia sekwencji peptydowej różnych grup funkcjonalnych, z których każda jest przeplatana przez grupę amidową.

peptydy i białka mają różne poziomy struktury.Pierwotna struktura białka to kolejność, w której znajdują się aminokwasy;To jest jego sekwencja peptydowa.Grupy funkcjonalne na białku oddziałują ze sobą, aby wciągnąć go w kształt.Indywidualne zwroty akcji i zakręty peptydu nazywane są jego wtórną strukturą.Jego ogólnym kształtem, wynikiem netto wszystkich tych zwrotów i zakrętów, jest struktura trzeciorzędowa peptydów.

Biochemiczne właściwości białek lub peptydów zależą od struktury trzeciorzędowej.Podobnie jak w przypadku wszystkich chemikaliów, białka przyjmą najbardziej sprzyjający kształt energetycznie.Ten kształt wynika z atrakcyjnych i odpychających sił między grupami na poszczególnych aminokwasach.Dlatego struktura trzeciorzędowa wynika ze struktury pierwotnej, co oznacza, że odstukanie sekwencji peptydowej określonego białka ostatecznie wyjaśni jego właściwości.

Opracowanie sekwencji peptydowej białka ma zastosowanie w projektowaniu farmaceutyków.Wiele procesów biologicznych zależy od działania białek, a leki często działają poprzez kopiowanie lub blokowanie działania tych białek.Zrozumienie zachowania białek może prowadzić do zaprojektowania bardziej skutecznych leków.Z tego powodu dział badań i rozwoju firmy farmaceutycznej zazwyczaj ma bibliotekę peptydową lub katalog peptydowy, który będzie stosował w poszukiwaniu nowych leków.